真新镇。
一座没有被任何色彩污染的小镇，代表一切开始的地方。
“小智，下来吃饭了，等会你还要到大木博士那里去呢！”动听的女声在一栋小楼中响起，一名穿着围裙的美丽少妇正站在楼梯下面朝二楼喊着。
可许久之后依旧听不见回应的声音，少妇无奈地摇了摇头，缓缓走上楼，推开了房门。
“你今年都7岁了，不可以再赖床了哦。”少妇双手插腰，有些不满地看着死赖在被窝里的儿子。
“老妈。”少年的脑袋缓缓钻出被窝，“我不想去，你帮我请假吧，就说我胃疼。”
少妇一愣，感到又好气又好笑，用力在被子上拍了一下。
“我跟你说过好几次了，撒谎是不对的！好了快点起床，待会你还要参加夏令营呢！”
说完，少妇也不等儿子答话，直接转身下楼了，而少年呆了一会，无奈地叹口气，渐渐陷入了沉思。
他本来是一名普通的大学生，却没想在一次意外中不幸丧生，等他再次睁开眼睛，却发现自己竟然成了刚刚出生的婴儿，而且还来到神奇宝贝的世界。
甚至还成为了这个世界的主角——小智！